《有机与药物合成化学II》是制药工程专业开设的专业基础课，包含有机化学及药物合成反应两部分内容。本课程的主要内容是在《有机与药物合成化学I》的基础上进一步学习有机化合物的命名、结构特征、制备以及与结构相关的物理、化学性质等理论和知识，掌握常用有机反应及机理，学会应用有机反应合成药物。通过理论和实验学习提高分析和解决实际问题的能力，能正确地、科学地、独立地进行合成反应实验工作，具有独立开展药物合成研究的能力。 有机化学考核的要求是掌握有机化学基本知识，包括命名、结构、基本概念（如杂化、异构、电子效应、空间位阻效应、亲电、亲核等）、基本有机反应类型及理论，并能熟练应用，进行命名、鉴别、合成等；了解有机化学基本原理、技能在科研和社会生活中的应用。